Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdac6Q9Z2V5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
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