Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms