Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Dctn3Q9Z0Y1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms