Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF4Q9UHB7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 358.7 ms