Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H0

Acox1, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acox1Q9R0H0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Acox1Q9R0H0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acox1Q9R0H0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms