Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Vav3Q9R0C8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vav3Q9R0C8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vav3Q9R0C8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vav3Q9R0C8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Vav3Q9R0C8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vav3Q9R0C8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vav3Q9R0C8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms