Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ57

Hspb3, Heat shock protein beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb3Q9QZ57 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hspb3Q9QZ57 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspb3Q9QZ57 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms