Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms