Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST12Q9NRB3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms