Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PRDM7Q9NQW5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM7Q9NQW5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM7Q9NQW5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM7Q9NQW5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM7Q9NQW5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM7Q9NQW5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM7Q9NQW5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM7Q9NQW5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM7Q9NQW5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM7Q9NQW5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM7Q9NQW5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM7Q9NQW5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM7Q9NQW5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM7Q9NQW5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRDM7Q9NQW5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRDM7Q9NQW5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms