Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nkain4Q9JMG4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms