Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l2Q9JLG4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms