Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1fQ9JIS7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.4 ms