Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pus3Q9JI38 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms