Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
EHD4Q9H223 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms