Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aph1cQ9DCZ9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms