Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fundc1Q9DB70 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms