Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD6

Pfn3, Profilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn3Q9DAD6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn3Q9DAD6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn3Q9DAD6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn3Q9DAD6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn3Q9DAD6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn3Q9DAD6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn3Q9DAD6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn3Q9DAD6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn3Q9DAD6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn3Q9DAD6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn3Q9DAD6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pfn3Q9DAD6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Pfn3Q9DAD6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pfn3Q9DAD6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfn3Q9DAD6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms