Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9W1

Pifo, Protein pitchfork, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PifoQ9D9W1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PifoQ9D9W1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PifoQ9D9W1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PifoQ9D9W1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PifoQ9D9W1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PifoQ9D9W1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PifoQ9D9W1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PifoQ9D9W1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PifoQ9D9W1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PifoQ9D9W1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PifoQ9D9W1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PifoQ9D9W1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PifoQ9D9W1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PifoQ9D9W1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PifoQ9D9W1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PifoQ9D9W1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PifoQ9D9W1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PifoQ9D9W1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PifoQ9D9W1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PifoQ9D9W1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PifoQ9D9W1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PifoQ9D9W1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms