Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9S1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9S1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9S1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9S1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D9S1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9S1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9S1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9S1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D9S1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms