Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms