Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hm13Q9D8V0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hm13Q9D8V0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms