Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf3c6Q9D8P7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c6Q9D8P7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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