Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc91Q9D8L5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms