Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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