Protein–RNA interactions for Protein: Q9D742

Ap5s1, AP-5 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5s1Q9D742 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms