Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms