Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms