Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms