Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms