Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp3Q9D032 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp3Q9D032 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp3Q9D032 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp3Q9D032 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp3Q9D032 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp3Q9D032 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp3Q9D032 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp3Q9D032 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp3Q9D032 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp3Q9D032 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp3Q9D032 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp3Q9D032 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms