Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SdhdQ9CXV1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SdhdQ9CXV1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SdhdQ9CXV1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SdhdQ9CXV1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SdhdQ9CXV1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms