Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms