Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmd8Q9CX56 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmd8Q9CX56 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmd8Q9CX56 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmd8Q9CX56 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmd8Q9CX56 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmd8Q9CX56 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmd8Q9CX56 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmd8Q9CX56 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmd8Q9CX56 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmd8Q9CX56 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmd8Q9CX56 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmd8Q9CX56 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmd8Q9CX56 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmd8Q9CX56 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmd8Q9CX56 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmd8Q9CX56 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmd8Q9CX56 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmd8Q9CX56 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms