Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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