Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atxn3Q9CVD2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms