Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms