Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp5f1Q9CQQ7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp5f1Q9CQQ7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 423.1 ms