Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DenrQ9CQJ6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DenrQ9CQJ6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms