Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms