Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms