Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab27bQ99P58 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms