Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nkd1Q99MH6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkd1Q99MH6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkd1Q99MH6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkd1Q99MH6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkd1Q99MH6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkd1Q99MH6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkd1Q99MH6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkd1Q99MH6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkd1Q99MH6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkd1Q99MH6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkd1Q99MH6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkd1Q99MH6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkd1Q99MH6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkd1Q99MH6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkd1Q99MH6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkd1Q99MH6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkd1Q99MH6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkd1Q99MH6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms