Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpifQ99KR7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpifQ99KR7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms