Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnip2Q99JG7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms