Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nrif1Q923B3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms