Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx18Q91ZR2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms