Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms