Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GcaQ8VC88 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GcaQ8VC88 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms