Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms